Специалисты АтлантНИРО занимаются изучением сырьевой базы рыболовства в Балтийском море, центральной и южной частях Атлантического, юго-восточной части Тихого и западной части Индийского океанов. Цель исследований - создание научных основ рациональной эксплуатации биоресурсов и эффективного их использования на базе современных технологий. Исследования проводятся по двум направлениям: биологическому и технологическому.